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1.抗氧化机理：大豆异黄酮的抗氧化机理体现在多个方面：(1)含有多酚羟基和苯羟基，可释放还原性氢并捕获自由基，阻断自由基的链式反应，从而保护脂质、蛋白质、DNA等大分子免受活性氧的攻击；(2)诱导抗氧化酶活性的增强；(3)螯合金属离子以减少或消除引发活性自由基链式反应的金属催化剂。
2.调节机制：动物体内的大豆异黄酮及其代谢产物雌马酚，由于其分子结构与动物雌激素相似，可结合并激活雌激素受体，从而表现为弱雌激素。而且大豆异黄酮既是雌激素的激活剂，又是雌激素的拮抗剂，即低剂量的大豆异黄酮雌激素效应较弱，而高剂量的大豆异黄酮可作为雌激素的拮抗剂。当异黄酮类似物在体内与雌激素竞争受体时，雌激素的细胞增殖促进作用就会减弱，从而降低雌激素相关肿瘤的发生率。此外，低浓度的异黄酮还可以影响前列腺特异性抗原的表达，从而下调雄激素受体的表达，减弱雄激素受体激活剂与雄激素反应元件在基因靶点上的结合，最终诱导前列腺癌细胞凋亡。
3.防癌抗肿瘤：大豆异黄酮最有意思的是它的防癌抗肿瘤作用。大豆异黄酮能结合并激活雌激素受体，雌激素受体易与前列腺分泌上皮、脑、尿道、乳腺细胞结合，从而产生免疫调节作用。大量实验证明了大豆异黄酮的防癌、抗肿瘤作用，尤其是对乳腺癌、前列腺癌、子宫内膜癌、直肠癌的防癌作用。
4.防治更年期综合征：大豆异黄酮对防治更年期综合征有显著效果。补充更年期大豆异黄酮的植物雌激素，可以减少或避免更年期综合征的发生。
5.绝经后骨质疏松症的防治：大豆异黄酮还能提高甲状腺对雌激素的敏感性，使甲状腺C细胞分泌降钙素，从而促进骨组织中骨盐的积累，对女性闭经后骨质疏松症起到治疗作用。临床试验证明，大豆异黄酮可增加骨矿物质密度，经常食用豆制品可缓解绝经后骨质疏松。
6.防治心血管疾病：大豆异黄酮还具有降血脂、防治2型糖尿病、防治心血管疾病和中风、防治肝脏和小肠中毒性炎症、保护心肌、抗乙醇摄入、保护肾功能等：保健功效。
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